在1867年的江户城，正值幕末的动荡时期。万事屋老板坂田银时（小栗旬 饰）和其伙伴们继续着他们不修边幅、充满黑色幽默的生活，与此同时，银时还面临着来自他过去的旧情旧友之间的纠葛。其中，冲田总悟（吉沢亮 饰）的姐姐三叶（北乃绮 饰），在得知自己即将嫁给藏场当马的消息后，身体突然恶化并住院治疗。此时，真选组组长近藤勋（中村勘九郎 饰）揭露了三叶未婚夫背后隐藏的非法走私军火行径，幕后黑手竟然是一个庞大且复杂的犯罪组织。总悟和银时必须联手，揭开这背后的真相，并为三叶讨回公道。同时，回忆中的土方十四郎（柳乐优弥 饰）与三叶之间的感情线也逐渐展开。尽管在过去的某个时刻，土方的决绝让这段情感戛然而止，但多年后，当面对着三叶病情的急转直下和背后的阴谋时，土方内心深处依然保留着对三叶最纯粹的情感。随着调查的深入，真选组内部也面临危机，银时和他的伙伴们必须在维护正义的同时，处理复杂的个人关系。《银魂 三叶篇》不仅为观众带来了紧张刺激的剧情，还深刻地描绘了角色之间的复杂情感纠葛与成长。
