《水浒少年2》以中华武术进军2008年奥运会为背景，讲述狗娃、大乖、豆豆和贾虎等入选集训队后的成长故事。这20名队员来自全国各地，其中郭大鹏、梅妞妞、叶子和秀才等曾获过少年武术比赛冠军，是高手如林的竞争环境。然而，在集训的第一天，狗娃与郭大鹏因一场不愉快的冲突而结下梁子，双方由此展开暗中较劲。华勇担任金牌教练，安排其他队员练习套路，唯独对狗娃等人进行基本功训练，这令狗娃等人的性格愈发桀骜不驯。爷爷的一张合影照片勾起了华勇十六年前在梁山的往事：他曾与郭大鹏的父亲同拜狗娃爷爷为师练武，一场大火烧毁了师傅居住的房舍及《燕青拳谱》，而狗娃爷爷误以为是徒弟所为。华勇回到省城后，在亲戚开设的水浒大酒店担任厨师长，并试图用水浒先人的故事开导队员。08班的班主任杨杨则通过英语教学，帮助队员们树立为国争光的决心。集训过程中，队员们不仅要面临高强度训练带来的伤痛与挑战，还要应对复杂的社会现象和价值观冲突。但狗娃的正义、大乖的侠义精神、豆豆的知错就改以及贾虎的善良品格逐渐影响了他们的人生观。最终，《燕青拳谱》失而复得，洗清了华勇的冤屈。郭大鹏也在父亲的行为中有所醒悟，并与狗娃等人一同踏上前往北京参加国家集训队选拔赛的征途。在汗水和泪水交织的训练馆里，他们收获了成长，也为国家荣誉奋斗着。
