《谍战狂花》的故事设定在四十年代后期的新海市。郑可玉与厉仲谋是旧日情人，如今却成了敌手。厉仲谋潜伏于军统，执行鼹鼠计划，企图将银行资金转移并牟取私利。他身居官僚资本银行行长之位，表面光鲜，实则老谋深算、手段狡猾。妻子水岺多次劝说他收手，但他仍不听，先后霸占了年轻貌美的赵青笠母女。当银行资金暴露后，厉仲谋为了保全自己，先利用郑可玉除掉异己周自成，再对郑可玉步步紧逼。与此同时，赵青笠在复仇的驱使下，先是派打手追杀或投毒欲置厉仲谋于死地，未果后又先后利用彭安萍、荣吉祥作为卧底，企图借郑可玉之手复仇。她以不同方式布设悬疑，关键时刻总能通过冒充中年男士宋先生的声音提醒和警告郑可玉。然而，彭安萍却爱上了郑可玉，两人坠入爱河，并在特殊身份的掩护下协助郑可玉揭露真相。郑可玉性格倔强、行事执着，但缺乏经验，始终被人利用，幸得兄长郑可为的帮助与保护。最终，在包彤、郑可为及彭安萍的帮助下，郑可玉与赵青笠结成联盟，与厉仲谋展开殊死较量。和平解放的新海市见证了厉仲谋的身败名裂，而赵青笠因过失伤人入狱，面对荣吉祥的求爱信时，流下了激动的泪水。此番恩怨情仇交织的故事，展现了人物在复杂环境下的人性挣扎与成长。
