《隋唐英雄3》的故事延续了前作的辉煌篇章。在玄武门之变后，李世民（郑国霖饰）登基成为皇帝，然而北漠依旧不宁，十八反王留下的残余势力与新崛起的渤辽国不断侵犯中原，给百姓带来了极大的困扰。罗通（张睿饰）、程铁牛（张卫健饰）和秦怀玉（杨德民饰）等一众青年将领在经历过多年的磨砺后已成长为成熟的军事领袖，他们携手并肩，最终夺得了帅位，并率领唐军出征平定了北漠的叛乱。与此同时，程咬金（张卫健饰）被任命为大军统帅，在龙门县招募新兵时，薛仁贵（黄海冰饰）泪别妻子柳金花（蔡静一饰），踏上了从军之路。初入军营，薛仁贵因身份低微仅担任火头军之职。然而他凭借着卓越的武艺和坚定的决心，在战场上屡建奇功，逐渐赢得了程咬金的认可与赏识，并被提拔为先锋大将。最终，在薛仁贵的带领下，唐军成功平定了渤辽国，实现了国家的再度统一。十年等待后，柳金花终于在龙门县等到了久别重逢的丈夫，一家人得以团聚，共同迎接了盛世的到来。李世民（郑国霖饰）在魏征（高森饰）、长孙无忌（陈良平饰）等贤臣的帮助下，开创了繁荣昌盛、贞观之治的时代。
